Dr Tom Braukmann

Domaines d’expertise

• Génomique
• Évolution moléculaire
• Bioinformatique
• Phylogénétique

Nominations

• Professeur adjoint, Département de médecine de laboratoire et de pathobiologie de l’Université de Toronto

Diplômes et agréments

• Doctorat en philosophie (écologie et biologie évolutionniste), Université de Toronto

Intérêts de recherche liés à SPO :

• Utilisation de la génomique pour détecter, prédire et comprendre l’émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (résistance aux médicaments) chez les agents pathogènes
•  Comprendre la dynamique de transmission des agents pathogènes en Ontario en vue d’améliorer les pratiques en matière de santé publique
• Utilisation de la métagénomique pour détecter les agents pathogènes émergents ou réémergents

Activités de recherche actuelles liées à SPO

• Étude de l’épidémiologie génomique de la sous-espèce pallidum de la bactérie Treponema pallidum, l’agent causant la syphilis
• Mise en place d’un environnement informatique infonuagique pour l’épidémiologie génomique
• Examen de la diversité virale pour comprendre les éclosions et les réseaux de transmission (par exemple, la variole simienne, la grippe, le VRS, le SRAS-CoV-2)
• Mise en œuvre de nouvelles solutions génomiques et bioinformatiques pour la génomique des pathogènes en Ontario

Principales publications

• Sachdeva H, Shahin R, Ota S, Isabel S, Mangat CS, Stuart R, Padhi S, Chris A, Mishra S, Tan DHS, Braukmann TW, Eshaghi A, Mejia EM, Hizon NA, Finkelstein M. Preparing for mpox resurgence: surveillance lessons from outbreaks in Toronto, Canada [Préparation à la résurgence de la variole simienne : leçons de surveillance tirées des éclosions à Toronto, au Canada]. J Infect Dis. 2024;229(Suppl 2):S305-12.
• Isabel S, Eshaghi A, Duvvuri VR, Gubbay JB, Cronin K, Li A, Hasso M, Clark ST, Hopkins JP, Patel SN, Braukmann TWA. Targeted amplification-based whole genome sequencing of Monkeypox virus in clinical specimens [Séquençage du génome entier du virus de la variole simienne basé sur l’amplification ciblée dans des échantillons cliniques]. Microbiol Spectr. 2024;12(1):E0297923.
• Duvvuri VR, Hicks JT, Damodaran L, Grunnill M, Braukmann T, Wu J, et al. Comparing the transmission potential from sequence and surveillance data of 2009 North American influenza pandemic waves [Comparaison du potentiel de transmission à partir des données de séquence et de surveillance des vagues pandémiques de grippe nord-américaine de 2009]. Infect Dis Model. 2023;8(1):240-52.
• Hasso M, Perusini S, Eshaghi A, Tang E, Olsha R, Zhang H, Lau E, Sullivan A, Cronin K, Lee S, Obando J, DeLima C, Nagra S, Braukmann T, Duvvuri VR, Richard-Greenblatt M, Corbeil A, Kus JV, Majury A, Patel S, Gubbay JB. Monkeypox virus detection in different clinical specimen types [Détection du virus de la variole simienne dans différents types d’échantillons cliniques]. Emerg Infect Dis. 2022;28(12):2513-5.

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